Les Marais des Basses Vallées de l’Essonne et de la Juine sont situés dans le département de l’Essonne, en zone péri-urbaine d’Ile-de-France. Ils font partie d’une vaste zone humide en aval des bassins versants des rivières Essonne et Juine, qui couvrent plusieurs centaines d’hectares, parmi lesquels les 500 hectares correspondant à la zone Natura 2000 du site ont été inscrits sur la Liste verte.
Les fonctionnalités écologiques des milieux caractéristiques du fonds de vallée ont été rétablies grâce à de nombreuses activités de restauration menées sur les hydrosystèmes et sur les tourbières, et à la réouverture de milieux envahis par des plantes ligneuses.
Le caractère patrimonial de certaines espèces et habitats présents dans les Marais des Basses Vallées de l’Essonne et de la Juine est affirmé par l’inscription de ces derniers sur les annexes des directives Habitats et Oiseaux. Dix habitats d’intérêt communautaire et plusieurs espèces d’oiseaux menacées à l’échelle du continent (dont le Blongios nain) contribuent à la valeur patrimoniale du site et justifient les périmètres de classement existant tant au niveau départemental, national, qu’européen.